Ariile protejate constituite pe teritoriul judetului Tulcea si recunoscute la nivel national, sunt in total 35, insumand o suprafata de 586.238,05 ha, din care o Rezervatie a Biosferei - Delta Dunarii care este structurata pe zone functionale astfel: zone cu regim de protectie integrala - 50.600 ha, zone tampon - 223.300 ha; Parcul National Muntii Macinului cu o suprafata de 11.321ha , 18 Rezervatii Stiintifice incluse in RBDD si 9 Rezervatii Naturale.

1. Rezervatia Biosferei " Delta Dunarii " - sit cu valoare de patrimoniu natural mondial si de zona umeda de importanta internationala, include in total 18 zone de protectie integrala din care15 in judetul Tulcea.
2. Parcul National " Muntii Macinului " - cu o suprafata de 11.321 ha, este situat pe teritoriul administrativ al localitatilor: Macin , Greci (situate in vestul parcului) comuna Cerna (amplasata in vestul si sud-vestul parcului), comunele Hamcearca si Luncavita (situate in estul acestuia) precum si Jijila (situata in partea de nord).
3. Rezervatia naturala " Varful Secaru " - rezervatia este situata in partea de vest a Podisului Babadag , la aproximativ 4 km sud-vest de localitatea Atmagea, comuna Ciucurova.
4. Rezervatia de liliac " Valera Oilor " - rezervatia este amplasata in zona central -nordica a Podisului Babadag, pe directia S-V, la 10 km distanta de localitatea N. Balcescu , respectiv la 2 km vest de DN Tulcea-Bucuresti, intre localitatile Ciucurova si N. Balcescu.
5. Rezervatia naturala " Valea Ostrovului " - rezervatia are o suprafata de 61,80 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Dorobantu.
6. Rezervatia naturala " Valea Mahomencea " - este amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Casimcea .
7. Rezervatia naturala " Uspenia " - rezervatia are o suprafata de 22 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Slava Cercheza.
8. Rezervatia naturala " Razboieni " - rezervatia are o suprafata de 41 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Casimcea.
9. Rezervatia naturala " Peceneaga " - rezervatia are o suprafata de 132 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Peceneaga.
10. Padurea "Valea Fagilor " - rezervatia avand o suprafata totala de 154 ha, este situata in perimetrul parcului National Muntii Macinului, in vecinatatea Comunei Luncavita, pe drumul judetean Luncavita-Nifon.
11. Padurea Niculitel - nu se cunoaste amplasarea exacta a rezervatiei si nici la cine se afla documentatia de constituire si planul de situatie.
12. Rezervatia naturala " Padurea Babadag - Codru " - rezervatia are o suprafata de 524,60 ha.
13. Rezervatia naturala " Muntele Consul " - rezervatia are o suprafata de 328 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunelor Izvoarele si Horia.
14. Rezervatia naturala " Muchiile Cernei-Iaila " - rezervatia are o suprafata de 1891 ha.
15. Rezervatia naturala " Manastirea Cocos " - rezervatia are o suprafata de 4,6 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Niculitel.
16. Rezervatia naturala " Magurele " - rezervatia are o suprafata de 292 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Topolog.
17. Rezervatia naturala " Lacul Traian " - rezervatia are o suprafata de 326 ha.
18. Rezervatia botanica " Korum Tarla " - rezervatia are o suprafata de 2,4 ha, fiind situata in partea de nord a Padurii Babadag, intr-o zona de platou, la circa 1 km de orasul Babadag. La vest se invecineaza cu popasul “Doi Iepurasi” si DN Tulcea -Constanta, iar la est cu Padurea Visterna.
19. Rezervatia de liliac " Fantana Mare " - rezervatia are o suprafata de 0,3 ha, fiind situata in zona central sudica a Podisului Babadag, la limita cu Podisul Casimcei, pe valea Topologului, la 3 km S-E de satul Fantana Mare. Rezervatia face parte din Unitatea de Productie Dumbrava.
20. Rezervatia naturala " Enisala " - rezervatia are o suprafata de 57 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Sarichioi.
21. Rezervatia naturala " Edirlen " - rezervatia are o suprafata de 25,50 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunelor Frecatei si Izvoarele.
22. Rezervatia naturala " Denistepe " - rezervatia are o suprafata de 305 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Mihail Kogaliceanu.
23. Rezervatia naturala " Dealurile Bestepe " - rezervatia are o suprafata de 415 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunelor Mahmudia si Bestepe.
24. Rezervatia naturala " Dealul Sarica " - rezervatia are o suprafata de 100,10 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunelor Frecatei si Niculitel.
25. Rezervatia naturala " Dealul Mandresti " - rezervatia are o suprafata de 5 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Niculitel.
26. Rezervatia naturala " Dealul Ghiunghiurmez " - rezervatia are o suprafata de 1421 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Dorobantu.
27. Rezervatia naturala " Dealul Calugaru - Iancina " - rezervatia are o suprafata de 130 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Jurilovca, la sud de Lacul Razim.
28. Rezervatia naturala "Dealul Bujorului " - rezervatia are o suprafata de 50,8 ha, fiind amplasata in zona central-nordica a Podisului Babadag, la aproximativ 4 km N-E de satul Atmagea (com Ciucurova).
29. Locul fosilifer "Dealul Bujoarele " - rezervatia are o suprafata de 8 ha, este alcatuita dintr-un complex de dealuri cu altitudini mici, amplasate in partea de SV a Muntilor Macin, la 5 km de localitatea Turcoaia, intre Granitul de Iacobdeal la vest si Culmea Priopcea la est.
30. Rezervatia naturala " Coltanii Mari " - rezervatia are o suprafata de 53 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Casimcea.
31. Rezervatia naturala " Chervant - Priopcea " - rezervatia are o suprafata de 568 ha, si este amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Cerna, drumul national Macin-Constanta, la nord de comuna Cerna, traverseaza rezervatia.
32. Rezervatia naturala " Casimcea " - rezervatia are o suprafata de 137 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Casimcea.
33. Rezervatia naturala " Carasan -Teke " - rezervatia are o suprafata de 4,6 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Izvoarele.
34. Rezervatia naturala " Beidaud " - rezervatia are o suprafata de 1121 ha, fiind amplasata pe teritoriul administrativ al comunei Beidaud.
35. Rezervatia geologica "Agighiol " - rezervatia are o suprafata de 9,7 ha, fiind amplasata in partea nordica a Lacului Razelm, la NV de localitatea Agighiol, intre Dealul Redi si Agighiol.